Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra4Q9D6F4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gabra4Q9D6F4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms