Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PudpQ9D5U5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PudpQ9D5U5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms