Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ShpkQ9D5J6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShpkQ9D5J6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms