Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al3Q9D4U4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2al3Q9D4U4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al3Q9D4U4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms