Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fam90a1bQ9D4F3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms