Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clvs1Q9D4C9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clvs1Q9D4C9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clvs1Q9D4C9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms