Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eaf1Q9D4C5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eaf1Q9D4C5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms