Protein–RNA interactions for Protein: Q9D416

Arl13a, ADP-ribosylation factor-like protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13aQ9D416 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arl13aQ9D416 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arl13aQ9D416 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arl13aQ9D416 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms