Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4933436I01RikQ9D3T1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms