Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrnp35Q9D384 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snrnp35Q9D384 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp35Q9D384 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms