Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl53Q9D1H8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl53Q9D1H8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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