Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab1bQ9D1G1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab1bQ9D1G1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms