Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cysrt1Q9D1E4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cysrt1Q9D1E4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms