Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syf2Q9D198 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syf2Q9D198 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syf2Q9D198 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms