Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf2e1Q9D0D5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf2e1Q9D0D5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf2e1Q9D0D5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms