Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pbdc1Q9D0B6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pbdc1Q9D0B6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms