Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc47Q9D024 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc47Q9D024 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc47Q9D024 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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