Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elp3Q9CZX0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elp3Q9CZX0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elp3Q9CZX0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms