Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm17509Q9CZ61 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17509Q9CZ61 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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