Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Klhl35Q9CZ49 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Klhl35Q9CZ49 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klhl35Q9CZ49 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms