Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChtopQ9CY57 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChtopQ9CY57 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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