Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis12Q9CY25 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mis12Q9CY25 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms