Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmed5Q9CXE7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmed5Q9CXE7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms