Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms