Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx10Q9CWT3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx10Q9CWT3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms