Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc3Q9CW03 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc3Q9CW03 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc3Q9CW03 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms