Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atxn3Q9CVD2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atxn3Q9CVD2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms