Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930553M12RikQ9CUH1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 651 ms