Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms