Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dis3Q9CSH3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dis3Q9CSH3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dis3Q9CSH3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dis3Q9CSH3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dis3Q9CSH3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dis3Q9CSH3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dis3Q9CSH3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms