Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRW3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRW3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRW3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms