Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029F12RikQ9CRB4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029F12RikQ9CRB4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms