Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ska2Q9CR46 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ska2Q9CR46 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms