Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Polr3kQ9CQZ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr3kQ9CQZ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms