Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg12Q9CQY1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg12Q9CQY1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms