Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp5f1Q9CQQ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms