Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mrpl35Q9CQL6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Mrpl35Q9CQL6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Mrpl35Q9CQL6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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