Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdzk1ip1Q9CQH0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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