Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nudt21Q9CQF3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nudt21Q9CQF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nudt21Q9CQF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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