Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9CQ90 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CQ90 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CQ90 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms