Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700029P11RikQ9CQ68 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029P11RikQ9CQ68 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029P11RikQ9CQ68 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029P11RikQ9CQ68 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029P11RikQ9CQ68 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700029P11RikQ9CQ68 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms