Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Use1Q9CQ56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Use1Q9CQ56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Use1Q9CQ56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Use1Q9CQ56 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Use1Q9CQ56 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Use1Q9CQ56 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Use1Q9CQ56 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Use1Q9CQ56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Use1Q9CQ56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Use1Q9CQ56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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