Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp3Q9CQ10 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms