Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc198Q9CPZ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc198Q9CPZ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms