Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim12aQ99PQ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Trim12aQ99PQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Trim12aQ99PQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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