Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Rrbp1Q99PL5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rrbp1Q99PL5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rrbp1Q99PL5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rrbp1Q99PL5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms