Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NsmfQ99NF2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms