Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atoh8Q99NA2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atoh8Q99NA2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atoh8Q99NA2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms