Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrrtQ99MR6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrrtQ99MR6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms