Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm2d1Q99MB3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms